In den Niederlanden wird der religiöse Status und die religiöse Natur der Scientology Kirche nicht angefochten. Im Laufe der Jahre haben sowohl die Exekutive als auch die Gerichte der Scientology als Religion und der Scientology Kirche als Religionsgemeinschaft, die ihren Gemeindemitgliedern religiöse Dienste anbietet, zahlreiche Anerkennungen gewährt. Die Scientology Kirche ist als eine Religionsgemeinschaft eingetragen und die Scientology Kirche ist eine rechtliche Körperschaft.
Regierungsministerien in den Niederlanden verleihen ihrer Anerkennung der Scientology Religion durch ihre Behandlung der Kirche, ihrer Mitglieder und Geistlichen Ausdruck. Beispielsweise gewährt das Justizministerium Scientology Geistlichen das Recht, Gefängnisse zu besuchen und ihre Dienste den Gefangenen zugänglich zu machen; das Ministerium für Erziehung, Kultur und Wissenschaft gewährt Scientologen das Recht, ihre eigenen Schulen für die Bildung ihrer Kinder im Einklang mit ihren religiösen Überzeugungen zu gründen; und die Steuerbehörde akzeptiert den Status der Scientology als Religion.
Im Jahre 2007 wurde die Petition einer Scientologin genehmigt, ihrer Tochter Heimunterricht zu geben. Sie hatte diese aufgrund der religiösen Überzeugungen ihrer selbst und ihrer Tochter eingereicht. Das Gericht stützte sich auf die Entscheidung des Europäischen Gerichtshofs für Menschenrechte im Fall Scientology Kirche gegen Moskau (5. April 2007, Antrag 18147/02) im Hinblick auf seine Entscheidung. Im Jahre 1991 wurde ein Steuerprüfer gemäß den Prinzipien religiöser Gleichberechtigung und Nichtdiskriminierung von seinen Vorgesetzten angewiesen, die Einkommenssteuererklärung eines Scientology Geistlichen genauso zu behandeln wie die Steuererklärungen von Geistlichen anderer Religionen.
